Truecrypt c'est apparament bien mais cela necessite l'installation d'un soft sur l'ordinateur, qui plus est en disposant des droits admin.
Le gros avantage de crypter les données avec TrueCrypt est que si tu perds ta clé USB elle apparaît comme non formatée à celui qui la trouve. Donc 1) il faut que le bonhomme ait l'idée de la monter sous TrueCrypt puis 2) qu'il connaisse ta phrase de passe ou qu'il arrive à craquer le cryptage.
Si tu es traqué par des services secrets effectivement il y a un risque qu'ils y arrivent, mais sinon tes données sont relativement à l'abri. 99% des quidams qui vont trouver/voler la clé vont simplement voir un message disant qu'elle n'est pas formatée et vont cliquer sur 'Oui' pour la formater.
Je stocke mes documents importants (copies des pièces d'identité, bulletins de salaire, avis d'impositions, etc) sur une carte SD de 2 Go qui est dans mon portefeuille, et si jamais je perds mon portefeuille je ne me ferais pas de souci à propos de ces documents.
Pour les plus prudents (paranoïaques ?) TrueCrypt permet même de créer des partitions cryptées à l'intérieur d'une partition cryptée. Au cas où quelqu'un te force à révéler ta phrase de passe, il n'accède qu'à un premier niveau de données.
Le désavantage est, comme tu le soulignes, qu'il faut impérativement un PC sur lequel TrueCrypt est installé pour accéder à tes données, c'est moins souple qu'un fichier crypté auto-extractible. En cas de crise majeure tes données sont tellement à l'abri que même toi n'y accèdes plus.
Avant que vous ne me voliez dans les plumes sur ce premier post, désolé de déterrer un sujet vieux de plusieurs mois, j'espère le faire en apportant plus de signal que de bruit, et oui oui, je vais aller me présenter bientôt dans la section adéquate, ce serait plus poli d'avoir commencé par là, je sais.